Trabajos Originales
Parámetros
forenses de diez microsatélites del Cromosoma X en una muestra de la población
del Estado Zulia, Venezuela
Forensic
parameters of ten X chromosome microsatellites
polymorphisms in a sample of the Zulia State population, Venezuela
José Miguel Quintero Ferrer, https://orcid.org/0000-0002-1488-79471,2,3, Tatiana Carolina Pardo Govea, https://orcid.org/0000-0001-6799-540X 1, Lisbeth Beatriz Borjas
Fuentes, https://orcid.org/0000-0001-8148-01031
1Instituto de Investigaciones Genéticas Dr. Heber
Villalobos Cabrera, Facultad de Medicina, Universidad del Zulia, Maracaibo,
Venezuela. 2Práctica Profesional Nivel I, Departamento de Salud Pública y
Social. Escuela de Bioanálisis, Facultad de Medicina, Universidad del Zulia,
Maracaibo, Venezuela.3Delegado por Venezuela ante la Sociedad Latinoamericana
de Genética Forense SLAGF.
Correspondencia a José Miguel Quintero Ferrer: jmquintero@fmed.luz.edu.ve
CITAR COMO
Quintero JM, Pardo T, Borjas L. Parámetros forenses de diez
microsatélites del Cromosoma X en una muestra de la población del Estado Zulia,
Venezuela. Rev. cienc. forenses Honduras. 2020; 6(1):3-13
ASPECTOS
ÉTICOS
Los autores declaran que no existe conflicto de interés en
la publicación de este artículo.
Todos los participantes firmaron consentimiento informado
autorizando la participación en el estudio.
AGRADECIMIENTOS:
A la Profesora Lisbeth
Borjas, por su enseñanza en este fascinante andar de la Genética Forense.
RECIBIDO: Diciembre 2019
ACEPTADO: Febrero 2020
RESUMEN
Justificación:
Las repeticiones cortas en tándem (STRs) están distribuidos
por toda la extensión del genoma humano, los ubicados en los cromosomas
autosómicos y en el cromosoma Y han sido ampliamente utilizados en los
laboratorios de genética forense debido a las características y patrones
hereditarios que estos poseen. Objetivo
A fin de caracterizar y determinar parámetros de interés forense en secuencias
de tipo STR del cromosoma X (DXS8378, DXS9902, DXS7132, DXS9898, DXS6809,
DXS6789, DXS7133, GATA172D05, GATA31E08 y DXS7423) en la población del Estado
Zulia. Metodología: Se eligieron 108 individuos (130 cromosomas X), cuyos ADN se
amplificaron mediante la reacción en cadena de la polimerasa, los fragmentos se
separaron por electroforesis capilar y los alelos reportados con respecto a la
escalera alélica. Resultados: El contenido de información
polimórfica demostró ser mayor de 0,5 en todos los microsatélites y el poder de
discriminación acumulado fue de 0,99999997 en mujeres y 0,99999816 en hombres. Conclusiones:
Los datos demuestran que los microsatélites del cromosoma X analizados son lo
suficientemente informativos como para ser utilizados en casos de vínculos
biológicos complejos y la identificación humana.
PALABRAS
CLAVE
Repeticiones Cortas en
Tándem, STR-X, Cromosoma X, Identificación humana.
ABSTRACT
Background: The Short Tandem Repeats are
distributed throughout the human genome, those located in the autosomal
chromosomes and Y chromosome have been widely used in forensic genetics
laboratories due to their characteristics and hereditary patterns. Objectives: In order to characterize
and determine forensic parameters of STR sequences of the X chromosome
(DXS8378, DXS9902, DXS7132, DXS9898, DXS6809, DXS6789, DXS7133, GATA172D05,
GATA31E08 and DXS7423) in the Zulia State population. Methodology: 108 individuals (130 X chromosomes) were selected and
their DNA was amplified using Polymerase Chain Reaction technique. The
amplified fragments were separated by capillary electrophoresis and the alleles
were assigned by comparison with the allelic ladder. Results: The average diversity was 0.7252, the Polymorphics Information
Content proved to be greater than 0.5 in all the X-STRs and the cumulative discrimination power
was 0.99999997 in women and 0.99999816 in men. Conclusions: The obtained data showed that the analyzed X-STRs are
sufficiently informative as to be used in cases of complex biological links and
human identification.
KEYWORDS
Short Tandem Repeats, X-STRs, X Chromosome, Human
Identification.
INTRODUCCIÓN
Las Repeticiones Cortas en
Tándem o STR (del inglés: Short Tandem Repeat), son polimorfismos
de longitud cuya unidad de repetición oscila entre 2 y 6 pb, pueden
analizarse con facilidad mediante la técnica de reacción en cadena de la
polimerasa (PCR), ya que los fragmentos amplificados varían de entre 60-400 pb,
además es posible realizar el análisis simultaneo de los locus STR mediante PCR
múltiplex, en donde son amplificados varios loci
simultáneamente en una misma reacción de PCR, siendo los productos de esta
reacción tipificados por un sistema de detección de fluorescencia1, 2.
Los STRs están ubicados por
toda la extensión del genoma humano, los ubicados en los cromosomas autosómicos
y en el cromosoma Y han sido ampliamente utilizados en los laboratorios de
genética forense debido a las características y patrones hereditarios que estos
poseen, a finales de la presente década se ha incrementado la investigación de
STRs del cromosoma X (STR-X) para ser empleados en el ámbito forense, debido al
beneficio de su empleo en casos de vínculos biológicos complejos donde el uso
de los STRs autosómicos y del cromosoma Y, aportan información irrelevante o no
es posible su aplicación 3-6. Como en el resto del genoma humano,
los marcadores STRs son abundantes a lo largo del cromosoma X con una densidad
comparable a los STRs autosómicos. Hasta la presente fecha se han identificados
55 STRs en el cromosoma X y se han caracterizados en más de 50 poblaciones (http://www.chrx-str.org/) de estos 55 X-STRs, 28 han sido utilizados
con fines forenses 7-11. El objetivo de este trabajo fue
caracterizar secuencias de tipo STR del cromosoma X (DXS8378, DXS9902, DXS7132,
DXS9898, DXS6809, DXS6789, DXS7133, GATA172D05, GATA31E08 y DXS7423) en una
muestra de la población del Estado Zulia, Venezuela.
Cuadro 1.
Características de los loci microsatélites analizados.
Loci |
Localización
cromosómica |
Secuencia
repetitiva |
Localización
Mb |
Distancia
en cM |
Rango
de alelos reportados |
Rango
de tamaños en pb |
DXS8378 |
Xp22.31 |
[CTAT]n |
9.330 |
20.21 |
7-17 |
106-146 |
DXS9898 |
Xq21.31 |
[TATC]n |
87.683 |
101.29 |
7-15 |
182-214 |
DXS7133 |
Xq22.30 |
[ATAG]n |
108.928 |
118.18 |
7-15 |
106-138 |
GATA31E08 |
Xq27.10 |
[AGAT]n |
140.062 |
160.54 |
7-15 |
222-254 |
GATA172D05 |
Xq23.00 |
[TAGA]n |
113.061 |
124.36 |
5-13 |
104-136 |
DXS7423 |
Xp28.00 |
[TCCA]n |
149.462 |
184.19 |
8-19 |
159-203 |
DXS6809 |
Xq21.33 |
[ATCT]n |
94.825 |
108.12 |
27-40 |
235-287 |
DXS7132 |
Centrómero |
[TCTA]n |
64.572 |
90.75 |
6-19 |
111-163 |
DXS9902 |
Xp22.20 |
[GATA]n |
15.234 |
32.32 |
7-16 |
165-201 |
DXS6789 |
Xq21.33 |
[TATS]n |
95.336 |
108.47 |
13-26 |
150-202 |
Tomado
de ChrX-STR.org 2.011. |
MÉTODOLOGÍA
Población y muestra: Muestra comprendida por 108 individuos, sin
relación de parentesco, residentes en el estado Zulia, Venezuela, las muestras
fueron seleccionadas independientemente de la edad y sexo de los individuos.
Todas las personas autorizaron el uso de su perfil genético para estudios
genético-poblacionales, una vez informado del compromiso institucional de
mantener los datos anónimos.
Extracción de ADN,
amplificación mediante PCR y caracterización por electroforesis capilar: El ADN de cada muestra sanguínea se extrajo previamente
mediante la técnica Salting Out modificada12, para la amplificación
de los diez STRs del cromosoma X, como se detallan en el Cuadro 1 se contó con la utilización de 2X Qiagen Multiplex
(Qiagen, Valencia, CA, USA) y 10X Primer Mix 13 que permite la
amplificación simultánea de los loci
en una PCR multiplex (del inglés, Polymerase Chain Reaction). Agua libre de nucleasa
3,5 µl; 10x Primer Mix
1µl; 2X Qiagen, Multiplex PCR Master
Mix 5 µl, en conjunto con 0,5 ng de ADN genómico en un
volumen final de 50 μl. Las condiciones de amplificación de la PCR fueron:
95 C 15 min; [94 C 30 s; 60 C 1 min 30s; 70°C 1 min], 10 veces;
[94 C 30 s; 58 C, 1 min 30 s; 72 C 1 min], 20 veces; 60 C
60 min, 4 C.
Para la electroforesis capilar se preparó una mezcla de
12,5 μl de Formamida Hi-Di™ (ThermoFisher Scientific, Waltham, MA, USA), 1 μl
de producto amplificado y 0,5 μl del control interno LIZ 500 (Thermo Fisher
Scientific, Waltham, MA, USA), luego fueron caracterizados en el equipo
semiautomatizado ABI PRISM® 310 Genetic Analyzer (ThermoFisher Scientific,
Waltham, MA, USA), el cual se acondiciono previamente utilizando POP-4 (del
inglés, Performance Optimized Polymer 4) y capilar de 47 cm de longitud por 50
μm de diámetro, bajo los siguientes parámetros de corrida: Tiempo de inyección:
5 s,
temperatura 60 °C y tiempo de corrida 24 min. Los datos
crudos se analizaron con el programa software GeneMapper® ID Software v3.2.1
(ThermoFisher Scientific, Waltham, MA, USA). Se caracterizaron las muestras de
referencia 9948 (Promega® Corporation, Madison, WI, USA) y 9947A de (ThermoFisher
Scientific, Waltham, MA, USA).
Análisis estadístico: Se estimaron algunos
de los parámetros estadísticos para validar la base de datos poblacional y
determinar si los STRs-X poseen niveles de diversidad suficientes que logren
avalar su aplicación con fines forenses y vínculos biológicos.
A continuación, se
especifican los parámetros estadísticos utilizados:
1.-Frecuencia alélica y frecuencia genotípica se calcularon
mediante el recuento de cada alelo y dividiendo este número por el número total
de alelos analizados.
2.-Heterocigosidad observada (Ho):
3.-Heterocigosidad esperada (He) 14:
4.-Homocigosidad observada (ho):
5.-Homocigosidad esperada (he):
6.-Probabilidad de coincidencia
en mujeres (PCM):
7.-Probabilidad de coincidencia
en hombres (PCH):
8.-Poder de discriminación en
mujeres (PDM):
9.-Poder de
discriminación en hombres (PDH):
10.-Probabilidad de
exclusión (PE):
11.-Probabilidad de exclusión en
medias hermanas (PEHS): se realizó según la fórmula de Gomes y
colaboradores15.
12.-Probabilidad de
inclusión combinada CPI:
13.-Media de
probabilidad de exclusión Tríos con hijas, cuando la madre y la hija son tipificadas
(padre-madre-hija) (MECTRIOS)16: MECTRIOS=
14.-Media de
Probabilidad de Exclusión Dúos padre-hijas, cuando sólo la hija es
tipificadas y no la madre (padre-hija), (MECDUOS):MECDUOS=
15.-Contenido de información
polimórfica (PIC) 17
El equilibrio de
Hardy-Weinberg (HWE)se realizó con el programa Arlequin versión 3.11 18.
La presente investigación se realizó siguiendo los lineamientos de la Sociedad
Internacional de Genética Forense (www. isfg.org).
RESULTADOS Y DISCUSION
El análisis de
sistemas STRs-X en la mayoría de los casos no tiene sentido si no es posible
una comparación entre el perfil de ADN perteneciente a una muestra indubitada y
el correspondiente a muestras dubitadas, así mismo, en la determinación de
vínculos biológicos complejos es necesario efectuar una comparación de los
diferentes perfiles genéticos obtenidos. Si estos perfiles son distintos entre
sí, puede asegurarse que ese resto biológico no pertenece al individuo en
cuestión o que ambos vestigios proceden de personas diferentes –exclusión–,
pero de existir concordancia –inclusión– entre los perfiles, es necesario hacer
una valoración estadística para estimar el grado de incertidumbre de que esos
perfiles coincidan entre sí sólo por razones de azar y no porque deriven del
mismo individuo, para ello es necesario disponer de datos fiables sobre las
frecuencias alélicas que están presentes en la población de referencia,
teniendo en cuenta que cada población posee una distribución de las frecuencias
alélicas particular, en cada caso debe de utilizarse una base de datos adecuada
y validada, es decir, aquella que refleje una distribución alélica de la
población a la que pueda pertenecer el potencial contribuyente de la evidencia
o muestra indubitada. Las frecuencias alélicas obtenidas a partir de una
muestra de la población del Estado de Zulia se muestran en el Cuadro 2.
Ahora bien, en años
recientes bases de datos de microsatélites del cromosoma X de las distintas
poblaciones o regiones geográficas específicas de cada país han sido publicadas
11, permitiendo el acceso y uso de las frecuencias alélicas
obtenidas para las estimaciones probabilísticas en casos de vinculo biológicos
y criminalísticos donde está presente la correlación de perfiles genéticos,
obteniendo así resultados que puedan ser admitidos ante un tribunal de
justicia. En conjunto con estas frecuencias usualmente son reportados
parámetros estadísticos relevantes como la diversidad genética y alélica,
probabilidad de coincidencia, poder de discriminación, entre otros, que generan
una perspectiva global de los STR-X en la población y permiten evaluar si los marcadores
polimórficos estudiados pueden ser utilizados en la práctica forense o no.
Distribución de frecuencias alélicas
y haplotípica:
El alelo más recurrente entre los 10 microsatélites fue el
9 en el sistema DXS7133 con una frecuencia de 0,5769 al igual que en las
poblaciones de Bogotá19, Santa Catarina, Brasil20 y el
noreste mexicano21 con 0,5650; 0,4510 y 0,5978 respectivamente. Los
menos frecuentes en la población zuliana fueron los alelos 9 en DXS8378, 9 y
13.3 en DXS9898, 7 en GATA31E08 y GATA172D05, alelos 30 y 37 en DXS6809, y
finalmente el alelo 14 en DXS9902, con una frecuencia de 0,0077 cada uno. En referencia a la variabilidad, se
hallaron 69 alelos diferentes, siendo los microsatélites DXS9898, GATA31E08 y
DXS6809 los que mostraron ser más polimórficos en relación al número de alelos,
nueve en total, seguido del sistema DXS7132 con ocho alelos, mientras que en la
investigación de Siza y colaboradores 19 los marcadores con mayor
variabilidad en referencia al número de alelos fueron el DXS6809 y DXS6789 con
11 alelos cada uno.
Equilibrio de Hardy-Weinberg: Para comprobar el equilibrio Hardy-Weinberg dentro de una
población, se comparan los datos observados y esperados para dicha muestra. Si
se detecta un exceso de heterocigotos, podría deberse a una selección dominante
o eventos estocásticos. En cambio, un déficit de heterocigotos podría deberse a
un efecto de la selección en la población, consanguinidad, al efecto Wahlund
por la existencia de estructura poblacional o bien a la existencia de alelos
nulos.
Este no parece ser el
caso en las muestras femeninas analizadas en el presente estudio, ya que no se
halló evidencias de una desviación del equilibrio Hardy-Weinberg, por lo que se
puede deducir que las proporciones de los genotipos para los STRs-X se
encuentran en equilibrio de Hardy-Weinberg (Cuadro 3), coincidiendo con otras poblaciones ya reportadas 13,15,19,20-22., además, se
descarta la presencia de alelos nulos o dominancia de alelos pequeños ya que en
todas las muestras masculinas hubo amplificación de todos los sistemas, por lo
que se puede afirmar que los oligonucleótidos hibridaron correctamente en las
regiones correspondientes.
Análisis de
desequilibrio de ligamiento (LD): En el presente estudio, el análisis del LD
índico posible ligamiento entre algunos STRs-X, sin embargo, tras el ajuste de
Bonferroni, se descarta esta posibilidad, al igual que las poblaciones de
Nicaragua y Uganda 15, 22.
Índice de
Homocigosidad (h) e Índice de Heterocigosidad (H): La heterocigosidad es un
parámetro indicativo de la cuantía del polimorfismo y eficacia de cada marcador
genético. De igual manera, la frecuencia de heterocigotos es una estimación
importante que representa la variación dentro de la población. El microsatélite
GATA172D05 mostro ser el más eficaz con un valor de (He) 0,8090; es decir, que
la probabilidad de que dos alelos del mismo locus (GATA172D05) tomados al azar
en una población sean distintos es de 80,90 % (Cuadro 3). Por el contrario, la homocigosidad es indeseada en los
microsatélites ya que disminuye la capacidad discriminatoria del marcador, por
lo que valores bajos en este índice son deseados en todos los marcadores, el
que mostro menor índice fue el sistema GATA172D05 (he) 0,1906;
Cuadro 2
Frecuencias alélicas de
diez STRs-X de 108 individuos de la población del estado Zulia, Venezuela. En
negrita se indican los alelos más frecuentes.
Alelos |
DXS8378 |
DXS9898 |
DXS7133 |
GATA31E08 |
GATA172D05 |
DXS7423 |
DXS6809 |
DXS7132 |
DXS9902 |
DXS6789 |
6 |
|
|
|
|
0,1385 |
|
|
|
|
|
7 |
|
|
0,0230 |
0,0077 |
0,0077 |
|
|
|
|
|
8 |
|
0,0154 |
|
0,0154 |
0,1385 |
|
|
|
|
|
8.3 |
|
0,0769 |
|
|
|
|
|
|
|
|
9 |
0,0077 |
0,0077 |
0,5769 |
0,1000 |
0,0692 |
|
|
|
|
|
10 |
0,4000 |
0,0231 |
0,1539 |
0,0538 |
0,2769 |
|
|
|
0,0462 |
|
11 |
0,2923 |
0,0846 |
0,2308 |
0,1385 |
0,2230 |
|
|
0,0308 |
0,4000 |
|
12 |
0,2769 |
0,3077 |
0,0154 |
0,3308 |
0,1462 |
|
|
0,1077 |
0,3846 |
|
13 |
0,0231 |
0,3615 |
|
0,2308 |
|
0,0615 |
|
0,1769 |
0,1615 |
|
13.3 |
|
0,0077 |
|
|
|
|
|
|
|
|
14 |
|
0,1154 |
|
0,0922 |
|
0,2924 |
|
0,2692 |
0,0077 |
|
15 |
|
|
|
0,0308 |
|
0,4769 |
|
0,2539 |
|
0,0154 |
16 |
|
|
|
|
|
0,1077 |
|
0,1307 |
|
0,0769 |
17 |
|
|
|
|
|
0,0615 |
|
0,0154 |
|
|
18 |
|
|
|
|
|
|
|
0,0154 |
|
|
19 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0,0692 |
20 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0,4154 |
21 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0,2539 |
22 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0,1231 |
23 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0,0461 |
29 |
|
|
|
|
|
|
0,0154 |
|
|
|
30 |
|
|
|
|
|
|
0,0077 |
|
|
|
31 |
|
|
|
|
|
|
0,1769 |
|
|
|
32 |
|
|
|
|
|
|
0,1615 |
|
|
|
33 |
|
|
|
|
|
|
0,2769 |
|
|
|
34 |
|
|
|
|
|
|
0,2154 |
|
|
|
35 |
|
|
|
|
|
|
0,0923 |
|
|
|
36 |
|
|
|
|
|
|
0,0462 |
|
|
|
37 |
|
|
|
|
|
|
0,0077 |
|
|
|
Rango de
alelos |
9-13 |
8-14 |
7-12 |
7-15 |
6-12 |
13-17 |
29-37 |
11-18 |
10-14 |
15-23 |
Número de alelos |
5 |
9 |
5 |
9 |
7 |
5 |
9 |
8 |
5 |
7 |
Frecuencia alélica mínima 0,0384 |
Cuadro 3.
Parámetros de interés forense en diez STR-X de la población del
estado Zulia, Venezuela.
|
DXS8378 |
DXS9898 |
DXS7133 |
GATA31E08 |
GATA172D05 |
DXS7423 |
DXS6809 |
DXS7132 |
DXS9902 |
DXS6789 |
Acumulado |
|
he |
0,3227 |
0,2527 |
0,4105 |
0,2045 |
0,1910 |
0,3321 |
0,1915 |
0,1983 |
0,3362 |
0,2652 |
- |
|
ho |
0,4091 |
0,2727 |
0,2273 |
0,2273 |
0,0909 |
0,4091 |
0,2727 |
0,1818 |
0,3636 |
0,3182 |
- |
|
He/DG |
0,6773 |
0,7473 |
0,5895 |
0,7955 |
0,8090 |
0,6679 |
0,8085 |
0,8017 |
0,6638 |
0,7348 |
- |
|
Ho |
0,5909 |
0,7273 |
0,7727 |
0,7727 |
0,9091 |
0,5909 |
0,7273 |
0,8182 |
0,6364 |
0,6818 |
- |
|
PCM |
0,2241 |
0,2782 |
0,2799 |
0,1464 |
0,0792 |
0,3577 |
0,0811 |
0,0843 |
0,2466 |
0,2084 |
0,00000003 |
|
PCH |
0,3326 |
0,2266 |
0,4621 |
0,1901 |
0,1963 |
0,3161 |
0,2201 |
0,2039 |
0,3540 |
0,2812 |
0,00000184 |
|
PDM |
0,7759 |
0,7218 |
0,7201 |
0,8536 |
0,9208 |
0,6423 |
0,9189 |
0,9157 |
0,7534 |
0,7916 |
0,99999997 |
|
PDH |
0,6674 |
0,7734 |
0,5379 |
0,8099 |
0,8037 |
0,6839 |
0,7799 |
0,7961 |
0,6460 |
0,7188 |
0,99999816 |
|
PE |
0,3940 |
0,5052 |
0,2784 |
0,5907 |
0,6158 |
0,3804 |
0,6150 |
0,6021 |
0,3745 |
0,4841 |
0,99895805 |
|
PEHS |
0,2420 |
0,3541 |
0,1843 |
0,4320 |
0,4446 |
0,2553 |
0,4456 |
0,2104 |
0,2376 |
0,3403 |
0,97934359 |
|
CPI/RMNE |
0,6060 |
0,4948 |
0,7216 |
0,4093 |
0,3842 |
0,6196 |
0,3850 |
0,3979 |
0,6255 |
0,5159 |
0,00104195 |
|
MECTRIOS |
0,6119 |
0,7098 |
0,5351 |
0,7690 |
0,7821 |
0,6169 |
0,7816 |
0,7731 |
0,5989 |
0,6987 |
0,99999395 |
|
MECDUOS |
0,4648 |
0,5737 |
0,3869 |
0,6441 |
0,6591 |
0,4710 |
0,6589 |
0,6482 |
0,4528 |
0,5604 |
0,99974086 |
|
PIC |
0,6119 |
0,7098 |
0,5351 |
0,7690 |
0,7821 |
0,6169 |
0,7816 |
0,7731 |
0,5989 |
0,6987 |
- |
|
HW |
0,5793 |
0,2341 |
0,7430 |
0,3759 |
0,7925 |
0,2469 |
0,3414 |
0,6483 |
0,3799 |
0,4913 |
- |
|
he: Índice de
homocigosidad esperada; ho: homocigosidad observada; He/DG: Índice de
heterocigosidad / Diversidad génica; Ho: Heterocigosidad observada; PCM: Probabilidad de coincidencia en mujeres; PCH: Probabilidad de
coincidencia en hombres; PDM:
Poder de discriminación
en mujeres; PDH: Poder de discriminación en hombres; PE: Poder de
exclusión; CPI/RMNE: Probabilidad de inclusión
combinada/ Hombre al azar no
excluido; PEHS:
Probabilidad de exclusión en medias hermanas con el mismo padre; PIC:
Contenido de información polimórfica; MECTRIOS: Media de
probabilidad de exclusión padre, madre e hija; MECDUOS: Media de probabilidad
de exclusión padre e hija; HW: valor de p
del test exacto del equilibrio Hardy-Weinberg, ajuste de Bonferroni para
comparaciones múltiples p≤0,005. |
||||||||||||
mientras que el que
presento mayor índice, como es de esperarse es el sistema DXS7133 (he) 0,4105
debido a la alta frecuencia del alelo 9.
Probabilidad de coincidencia (PC) / Probabilidad de
identidad (PI): En la población zuliana se obtuvo un valor combinado de
0,00000003 en mujeres y 0,00000184 en hombres, lo que representa que la
probabilidad de encontrar dos mujeres con igual genotipo en los diez STRs-X
contemplados en esta investigación, es de 1 en 3,3 × 107; mientras que
en hombres esa probabilidad es de 1 en 5,4×10 5. En la práctica
forense esta probabilidad puede aumentar
en caso de obtener un
perfil parcial por degradación o cuanto existe reducción del número de locus
informativos. Además, también puede aumentar si el sospechoso y el culpable
real tienen parentesco o si se originan de la misma subpoblación. El único caso
excluible a estos valores es el de los gemelos monocigóticos, ya que comparten
el mismo material genético.
Poder de
discriminación (PD): El poder de discriminación determina la probabilidad de
que un marcador o conjunto de marcadores sean capaces de diferenciar
genéticamente a individuos no relacionados entre sí, tomados al azar en la
población. El valor del PD de cada marcador localizado en el cromosoma X
difiere entre hombres y mujeres. En el caso de muestras pertenecientes a
mujeres, con la utilización de STRs-X se puede obtener un rendimiento similar o
mejor que al utilizar marcadores autosómicos 23, pero en muestras
pertenecientes a hombres, el valor PD obtenido será más bajo, debido a que sólo
se utiliza un alelo por cada STR utilizado.
El sistema que mostro
mayor PDM, fue GATA172D05 con 0,9208 y PDH, GATA31E08 con 0,8099; valores muy
similares al grupo femenino de Santa Catarina, Brasil 20 que mostro
un PDM de 0,9066 y PDH de 0,7896 para los mismos sistemas.
El marcador que
presento menor PD en la población femenina fue DXS7423 0,6423; teniendo en
cuenta que el PD es proporcional a las frecuencias alélicas y que los
marcadores con mayor índice de PD son aquellos que presentan alelos con más baja
frecuencia, lo que indica que el marcador DXS7423 está poco distribuido en
relación a sus frecuencias alélicas, ya que escasamente dos alelos, 14 y 15
obtuvieron una frecuencia sumada de 0,7692; mientras que los tres alelos restantes presentaron una frecuencia muy baja en comparación con estos
dos alelos. Lo mismo ocurrió en hombres en el sistema DXS7133, en donde solo el
alelo 9 posee una frecuencia de 0,5769.
Es importante
enfatizar que el PD acumulado en esta investigación fue de 0,99999997 para
mujeres y 0,99999816 para hombres, es decir, que dos personas no relacionadas,
tomadas al azar en la población zuliana pueden ser diferenciados mediante los
diez STRs-X con una probabilidad del 99,999997 % en mujeres y 99,9998 % en
hombres, de este modo, queda comprobada la capacidad discriminatoria de los
diez marcadores STRs-X, y su empleo en la identificación humana y vínculos
biológicos complejos en la población zuliana es incuestionable.
El poder de exclusión
(PE): La probabilidad de exclusión se define como la probabilidad de que un
marcador genético o conjunto de marcadores conduzca a la exclusión de un
sospechoso, en otras palabras, la probabilidad de que una persona sea excluida
como contribuyente de un perfil genético obtenido en la escena del crimen antes
de cualquier dato obtenido, en la población zuliana es del 99,89 % considerando
los diez sistemas analizados en esta investigación.
El PE está relacionado
directamente con la distribución de las frecuencias alélicas, lo que determina
el grado de polimorfismo del marcador. Para los marcadores del cromosoma X,
este parámetro es relevante cuando se dispone de la abuela paterna en ausencia
del padre, en casos que implican la investigación de una hija como en tríos
padre, madre e hija, y en dúos familiares padre e hija en ausencia de la madre.
También en pruebas de maternidad que involucre a dúos madre e hijo24.
Probabilidad de
exclusión en medias hermanas con el mismo padre (PEHS): En presuntas medias
hermanas con el mismo padre, el empleo de secuencias mitocondriales es
descartado, debido a que el genoma mitocondrial es heredado de madre a hijos/as
exclusivamente, al igual que el cromosoma Y que es heredado únicamente de
padres a hijos, el modo particular de transmisión del cromosoma X lo hace
invaluable en casos donde el resultado de marcadores autosómicos es inconcluso,
estrechando la posibilidad de un resultado concluyente si los STRs-X no son
utilizados23. Para los diez STR-X la PEHS fue de 0,97934359; es
decir, que dos mujeres no relacionadas y seleccionadas al azar de la población
zuliana, tienen una probabilidad de diferenciarse genéticamente como medias
hermanas con el mismo padre de 97,93 %.
Probabilidad de inclusión
combinada (CPI): La CPI es la probabilidad de incluir falsamente a un individuo
como contribuyente del material orgánico dejado en la escena del crimen antes
de cualquier dato obtenido, en la población zuliana esta probabilidad es de
0,10 %.
Media de Probabilidad
de Exclusión (MEC): La MECTRIOS expresa la probabilidad que poseen los diez
STRs-X analizados en esta investigación de excluir a un presunto padre cuando
madre e hija son tipificadas, la cual es de 99,9993 %. Mientras que cuando solo
la hija es tipificada (MECDUOS) esta probabilidad es del 99,97 %.
El microsatélite que
mostró una MEC más elevada fue GATA172D05 tanto en tríos con un 78,21 % como en
dúos con 65,91 % valores muy similares a los reportados en la población de Río
de Janeiro, Brasil con 78,33 % y 66,04 % respectivamente, para este mismo marcador 25.
Contenido de
información polimórfica (PIC): El PIC evalúa lo informativo que es un marcador
midiendo su capacidad para identificar que alelo se ha heredado de cada uno de
los parentales, mide la capacidad discriminatoria de los loci. Su valor depende del número de alelos y de la distribución de
frecuencias, es decir, que se pueda identificar al progenitor del que procede
el alelo 17, en esta investigación tomando en consideración toda la
población, se obtuvieron valores por encima de 0,5 en todos los STRs-X (Cuadro 3), siendo el menor valor 0,5261
en el marcador DXS7133 y el mayor 0,7823 en GATA172D05. El valor en el sistema
DXS7133 se debe a la elevada frecuencia del alelo 9, la cual es de 0,5966 (59 %
de las frecuencias) lo que disminuye el valor del PIC, sin embargo, sigue
siendo mayor de 0,5 lo que indica, que tanto este como el resto de los STRs son
altamente polimórficos. Resultados similares se aprecian en otras poblaciones como
la tibetana y uygur26, donde el rango de PIC fue de 0,4113 (DXS7423)
a 0,8083 (DXS6789) y la población mexicana21 con 0,4907 para DXS7133
a 0,7684 para el sistema DXS6809.
Un índice de
polimorfismo elevado es lo que ratifica el uso de los microsatélites como
marcadores en las pruebas de vínculo biológico y en la identificación humana,
ya que la probabilidad de encontrar dos individuos con los mismos alelos para
los diez microsatélites es mínima.
CONCLUSIÓN
Los datos derivados de
esta investigación han permitido la creación de una base de datos de
microsatélites del cromosoma X en una muestra de la población del Estado Zulia,
además de demostrar que los STR-X son lo suficientemente informativos para
considerar su empleo como estrategia en la identificación humana y vínculos
biológicos complejos.
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